马头山国家级自然保护区始建于1994年，2001年经江西省人民政府批准晋升为省级自然保护区，2008年经国务院批准晋升为国家级自然保护区。保护区位于江西省资溪县的东北部，地处武夷山脉中段，闽赣交界的武夷山脉西麓，地理坐标为东117°09'11"-117'18"，北纬27°40'50"-27°53'52"，保护区总面积13866.53公顷，其中核心区4286.08公顷、占保护区总面积的30.9%，缓冲区3438.72公顷、占24.8%，实验区6141.73公顷、占44.3%。